La metilación del DNA juega un papel clave en la regulación de genes involucrados en la regulación de la homeostasia de glucosa. La metilación del promotor Ins2 deriva en la unión de la proteína 2 ligadora de metil CpG, lo que sugiere también un mecanismo para el silenciado del gen de la insulina, se cree que en esta enfermedad las citocinas de las islas CPG están metiladas lo que provoca un silenciamiento del promotor, otro factor afectado por la metilacion de las citocinas es el transportador de glucosa 4 el cual va a la membrana plasmática en respuesta a la insulina y desempeña un papel clave en la regulación del equilibrio de la glucosa, este factor es inhibido en respuesta a la metilación en las islas CPG y como consecuencia se presentan problemas a nivel del equilibrio de la glucosa dentro del organismo.
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